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克服DNA凝胶成像系统中的选择悖论

可能难以缩小商用仪器的广泛领域。Bio-Rad的全球产品经理Raymond Miller表示,很难研究市场并确定客户对凝胶成像系统的认可,因为这些系统使用得非常广泛。“这是一种无处不在的技术。如果你是生命科学,你需要访问凝胶doc系统。几乎在我遇到过的每一个小组中,这几乎都是强制性的。“

在此,我们将讨论一些关键特性,包括多功能性,灵敏度,动态范围和易用性,这是选择DNA凝胶成像系统时的重要考虑因素。

灵敏度和动态范围

福建11选5开奖结果查询 尽管一些DNA成像应用仅需要粗略测量或“是或否”结果,但大多数使用凝胶成像系统的研究人员正在寻找**佳的数据质量。

福建11选5开奖结果查询 灵敏度和动态范围是在选择系统时在特定应用的上下文中要考虑的数据质量的两个方面。

据Uvitec有限公司董事总经理Karine Victory说,很多人都认为相机分辨率是评估CCD相机系统灵敏度的**佳参数。“事实上,当她说,”灵敏度是通过大镜头光圈,出色的低噪声相机,进一步深度冷却任何相机电子噪声,以及距镜头**近的距离样本确保了这一点。“她提醒说,一种称为装箱的练习会牺牲CCD相机的分辨率。分档是通过将总像素转换为更大像素来增加相机灵敏度的过程。它允许在图像捕获时收集更多光,但通过减少像素总数来降低总分辨率。“有分箱选项很好,

Uvitec的化学发光成像范围从专用的化学系统(Minihd9),独立系统(Minihd9 touch)可选荧光,或化学+ UV荧光和可选的epi荧光印迹(联盟9。7和9。7色度)的组合系统都包括原生900万像素CCD摄像头,三级珀耳帖冷却**-60度。

福建11选5开奖结果查询 灵敏度是UVP(Analytik Jena公司)开发的凝胶成像系统的优先考虑事项。GelDoc-It TS3是DNA和蛋白质凝胶的独立成像系统。它配备了5。0-MP摄像头和广角f / 1。2镜头,可提供高分辨率和快速图像捕捉。该系统还可以使用冷却**-57°C的CCD相机进行升级,以进行化学发光成像。

UVP产品经理Sarah Chaudhury表示,**新一代GelDoc-It系列成像仪的改进包括“更敏感的相机和光学系统,以及用于图像捕捉和分析的一键式自动化”。

动态范围与灵敏度密切相关。大动态范围允许在同一图像中检测低和高水平的样本。动态范围可以是某些应用的重要考虑因素,例如监测刺激化合物或抑制剂对目标靶标表达的影响。

LI-COR Biosciences提供的动态范围超过6个对数的仪器。根据LI-COR的**产品营销经理Jeff Harford的说法,这意味着图像永远不会饱和。LI-COR的Odyssey Fc成像仪  设计用于溴化乙锭染色的DNA凝胶或其他染料,如SYTO 60或SYBR,并配有一次性托盘以减少污染。该的奥德赛CLX  是专为SYTO 60染料使用。

根据Harford的说法,在评估凝胶成像系统中的技术时,数据采集的一致性是一个重要的考虑因素。“具有宽动态范围的技术可以获得从凝胶到凝胶的一致数据,”他说。“确保该技术具有前瞻性。出版商非常关注可靠且可重复的数据,因此您需要确保您的系统能够日复一日地提供可靠的数据。系统可以采取的任何措施来消除凝胶或印迹到印迹的可变性都很重要。“

多功能性

虽然简单,专用的一次性凝胶成像系统似乎是一个吸引人的选择,但大多数客户对可以分析的凝胶类型,检测方法和应用范围方面具有更多功能的系统感兴趣。许多制造商正在回应具有多种功能的仪器,例如多重荧光检测,与比色样品或放射性标记样品的兼容性,甚**是其他成像应用,如蛋白质印迹和组织切片分析。

GE Healthcare Life Sciences提供一系列激光扫描仪,在检测方法和应用方面具有极为广泛的多功能性。其Amersham Typhoon 5 Biomolecular Imager可以对荧光,放射性标记和比色样品进行成像。除了使用DNA凝胶,蛋白质凝胶和印迹外,该系统还可用于成像和分析微孔板,培养皿,组织切片和许多其他样品类型。

激光扫描仪的核心是它的光电倍增管。它们设计用于检测从非常弱到非常强的信号,它们提供宽动态范围,使扫描仪的多功能性成为可能。 

激光扫描仪还可以容纳一系列样品格式,从玻璃载玻片上的小样品到大型扁平盒式磁带。

除激光扫描仪外,GE还提供两种可用于DNA凝胶记录的CCD相机系统,ImageQuant LAS 500  和更先进的Amersham Imager 600。在选择成像仪时,研究人员应考虑是否需要化学发光检测GE医疗生命科学**科学家Erik Bjerneld说:“如果用户主要对化学发光感兴趣,那么我们建议使用CCD成像仪。如果荧光成像或荧光成像的灵敏度和分辨率很重要,那么我们推荐使用这种激光扫描仪,“Bjerneld说。

安全性和易用性

虽然数据质量和多功能性是选择系统时的关键考虑因素,但市场上有这么多仪器,安全性和易用性正在成为选择的重要因素。一个增长趋势是凝胶文件的自动化。这意味着,理想情况下,能够将凝胶放入系统中,并且只需按一下按钮即可进行分析。大多数系统提供一定程度的自动化。例如,UVP的GelDoc-It TS3配备了广泛的自动化功能。通过其VisionWorks软件自动进行图像捕获,该软件使用预设捕获设置(如自动曝光,聚焦,变焦和照明)进行一触式图像捕获。

使用凝胶记录的用户体验的另一个方面是安全性,主要是关于溴化乙锭的使用。使溴化乙锭成为DNA的良好染料的相同特性 - 其插入DNA碱基的能力 - 也使其成为强烈的诱变剂和需要特殊处理的健康风险。这些预防措施通常包括使用手套,防护设备和隔离受溴化乙锭污染的仪器。新的,更安全的染料可用于DNA凝胶,许多仪器供应商已经优化了他们的系统,以便使用更安全的选项来支持想要逐步淘汰溴化乙锭的研究人员。

根据米勒的说法,人们长期以来一直拒绝摆脱溴化乙锭,但这种情况开始发生变化。“转型终于发生了。我们看到更多的研究人员对更安全的荧光染料表示了兴趣,“他说。

易用性也是Bio-Rad的优先考虑事项。其产品包括基本的入门级Gel Doc EZ系统,功能更全面的Gel Doc XR +系统  和用于工业规模凝胶成像的GS-900校准密度计。“我们付出了很多努力,使系统尽可能简单,”米勒说。这包括自动化凝胶成像的大部分工作,例如缩放和聚焦。

麻省理工学院的研究人员Arnaud Gutierrez也认为易用性是凝胶文献系统的一个有吸引力的特征。“我们使用Azure C400  进行DNA凝胶和荧光蛋白质印迹。这是一个非常用户友好的凝胶文档。我们对它非常满意。小尺寸的设备是我们选择的关键。荧光多路复用以及预染色的凝胶工作正常,“古铁雷斯说。

DNA凝胶成像系统市场成熟且竞争激烈,在多个价位上有许多选择。在选择系统时,个人需求以及特定应用应始终是首要考虑因素。特定实验室的选择归结为详细信息,例如仪器的性能与实验室**的染料和特定应用以及在检测方法之间切换的能力。很难找到针对特定应用的仪器的头对头比较,因此密切关注产品文献和与公司代表的沟通对缩小选择很重要。此外,系统应该面向未来,在考虑新技术和开发技术的情况下购买。

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