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凝胶成像系统:如何为您选择一个

快速:您实验室中**常用的设备是什么?移液器可能占据首位,但凝胶文件系统可能位居前三位。

凝胶文件系统实际上只不过是一个微型暗室和相关的相机。在80年代后期和90年代早期,这些系统实际上是便携式暗室,包括安装在金字塔底座上的基本宝丽来打印相机。将组件放在灯箱上的凝胶上,然后拍摄照片。一旦开发打印所需的几秒钟过去,生成的灰度照片就会粘贴到实验室笔记本中。

但DNA和蛋白质凝胶不仅仅是令人钦佩的图像,就像家庭相册中的照片一样; 他们是数据。必须对它们进行研究,分析,注释和(希望)发表。它们还必须存储并可供以后检索。不幸的是,这些任务对于打印图像来说都不是很简单,打印图像可能会损坏或丢失,并且必须扫描到计算机中以进行后续图像分析。

幸运的是,今天的实验室工作人员有更复杂的选择。现代凝胶文件系统的范围从半自动到全自动,具有多功能外壳,计算机控制的激发和检测系统以及分析软件。这些装置不仅可以处理DNA和蛋白质凝胶,还可以处理化学发光蛋白质印迹,荧光,甚**放射自显影。出于本文的目的,我们将讨论限制在**基本的系统 - 那些可以处理DNA和蛋白质凝胶的系统。

应用

购买凝胶文件系统时,首先询问,我的需求是什么?您是否将该系统专门用于DNA和蛋白质凝胶,或者您是否还需要记录荧光实验,化学发光蛋白质印迹和放射自显影?在前一种情况下,几乎所有系统都会这样做,您的选择将取决于您想要花多少钱以及您决定需要哪些功能; 在后一种情况下,您需要考虑更高端的选择。

福建11选5开奖结果查询 “通常,切断点是,他们是在做化学发光西部片吗?” Cell Biosciences的产品经理Peter Chiang说。化学发光需要冷却的CCD相机,这比通常与凝胶文件系统捆绑的相机贵得多。

价钱

福建11选5开奖结果查询 蒋说,一旦潜在客户确定了他们的应用程序,他们首先要知道的是,系统将花费我多少钱?“这通常是讨论开始的地方,价格范围是多少,”蒋说。

当然,这是俄亥俄州立大学兽医学院研究科学家Kate Hayes-Ozello的“**大因素”,他参与购买学院的两个AlphaImager系统(**初由AlphaInnotech出售,现在由细胞生物科学)。“价格是我看到的**件事,”她说。

一般来说,基本的凝胶文件系统的价格可能低于10,000美元,可能低于5,000美元,具体取决于相机质量,自动化水平和系统捆绑软件质量等特性。例如,Cell Biosciences的凝胶文件系统从基本的AlphaImager Mini的3,800美元到**的AlphaImager HP的12,000美元。

灯光

DNA和蛋白质凝胶具有相对简单的照明要求。对于用溴化乙锭或SYBR绿染色的DNA凝胶,您需要一个紫外透射仪。对于考马斯染色的蛋白质凝胶,你需要白光透照。您可能还希望进行白光落射照明(即,从上方照射)用于成像,例如细菌板,和/或蓝光“转换器屏幕”,其可以将UV光转换为蓝光以切除SYBR绿 - 染色DNA条带而不损坏它们。(如果您确实需要从凝胶中切除条带,请寻找可以将透照仪从系统机柜中取出以便于接触凝胶的系统。)

摄像机/光学

当然,凝胶文件系统操作的关键是用于捕获图像的相机和镜头。

“你可能首先要看的是相机,”蒋说,“这通常是**昂贵,**具差异化的部分。”

福建11选5开奖结果查询 首先,蒋说,解决; 大多数gel-doc系统都有“科学级”相机,分辨率在0。3到2百万像素(MP)之间,他说 - 低于1 MP的任何东西都被认为是“低端的”。

接下来,考虑一下镜头。它们是固定的,还是可以放大?什么是**大放大倍率,是变焦光学(即镜头实际移动)还是电子(如手机相机)?镜头是电脑控制的还是手动的?**后,根据您的需要,您可能还需要考虑可以在相机前放置多少个不同的滤镜。

例如,AlphaImager Mini包括一个1.3-MP,12位摄像头(一个12位摄像头可以捕获2 12或4,096个灰色阴影),一个位置的滤光轮(标准配置包括一个橙色滤镜)对于溴化乙锭,虽然有其他可用)和手动变焦镜头(8-48毫米,f / 1.2)。所述Syngene公司 GENI包括2-MP,12位的摄像头,马达驱动,六位置滤光轮,和一个电动变焦。

使用方便

鉴于您可以期待凝胶文件系统的使用量,易用性是一个关键考虑因素。

“实验室应该考虑我(例如,实验室经理)使用的容易程度,以及我将需要培训多少人,” Bio-Rad实验室成像营销经理Ryan Short说。“或者,系统是否如此直观,您可以立即行走并立即使用它?”

Hayes-Ozello的购买决定考虑了简单性,因为她购买的系统是部门资源。“只需极少的培训,用户就可以拍照并快乐地走,”她说。“它不需要核心经理的大量培训......这才是我们真正想要的。”

福建11选5开奖结果查询 易用性难以量化,Short承认,但有一些因素需要考虑。例如,拍摄照片需要多少操作相机设置,以及这些任务的自动化程度如何?“你可以走到系统,按几个按钮,拍出好照片,还是你需要调整焦距,变焦和光圈?” 他问。

软件

当然,易用性计算的一部分是用于捕获和分析图像的软件。即使是**基本的凝胶文档系统也包括采集软件,它应该允许用户控制亮度,变焦和聚焦。但并非所有系统都能让您分析图像(例如,识别泳道,量化特定条带中的DNA量,并测量其分子量)。

例如,AlphaImager Mini包括采集软件,但分析软件是可选的。但是,AlphaImager HP包括两种标准。另一方面,Syngene的GeneTools分析软件包及其所有凝胶文件系统,产品和销售支持专家Maggie Pochyla说。“我们的核心竞争力之一就是软件,”她说。

在考虑系统附带的软件时,还要考虑如何使用该系统的后勤。采集软件只需要安装在与设备相关的计算机上,但分析软件呢?大多数研究人员可能更愿意在他们自己的计算机上处​​理这些数字,特别是如果凝胶文档系统在核心设施中或有一个队列使用它。“你不想站在机器旁边进行分析,”肖特说。

因此,请询问系统捆绑了多少软件许可证,以及您收到多少次升级(或者您有多长时间获得这些许可证)。如果分析软件已联网,请务必与您的IT部门核实,以避免任何安装问题。

什物

基本的凝胶文件系统并不多,但正如他们所说,魔鬼在细节中。考虑到这一点,这里还有一些其他选择:

系统是否可升级?
例如,如果您现在不需要化学发光或荧光,但预计在未来几年内需要这些功能,您可以升级现有系统,还是必须购买一个全新的系统?“每个人都会选择这种模块化的软件和硬件,”Pochyla说,“所以你不必购买劳斯莱斯,你可以买到你需要的东西。”

什么是系统足迹?
在大多数实验室中,空间非常宝贵,因此系统越小越好。一些凝胶doc系统由相关的PC控制; 其他(例如Syngene GENi和Cell Biosciences Red)具有带触摸屏界面的内置计算机。

你将如何检索你的数据?(通过网络?使用USB密钥?)
将图像转换为出版品质的数字有多容易?软件可以自动导出到高分辨率图像(通常为300 dpi或更高),还是必须使用其他软件(如Adobe Photoshop)来执行此操作?

供应商多久更新一次软件?
凝胶文件系统的使用寿命大约为七到八年,估计很短,因此提前考虑很重要。“你想确保系统提供对当前操作系统的访问,”他说。

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